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/home/cluster1/data/bu01/1121861/jlex/alignment/alignments/26695_J99-postL2_IGR.txt
>J99-L2-Green-non-RD_+_RC GCTTGCTTAAAGATAACAAAGATGAATGTGCATGCACTTGAATTAAGGATAAGGATCAATCTAACCCAATCTCTAAAAAAGAGCTTTAAGTTACTAGACTTACGATGTTAAACAAGGGTGTAATTGAATTTCTCAAGGCTTGATTGAGAGGAATGCTAATAATTTGGTAGGTCAAAAGGAATGATAAAGGCTTACACTCAAGCAGAGAGTGAATGTTTAGCTAGCGAGTTATTACCTATTATTCCCTTTAAAAGGGTGTGAATTTGGGTATCAAGGCAGACTTGTATCAAGTTTTATTGGAATGGATTAGAAAAATCTGATTGGATTGACCCTCACAATTTTTCAAACCAATCGTTTAATAGCGATTAAATATGACTATATATACTACAAAAATAAGATTTTGATGGGTAAGATTGTTTTTTGAAAGGATTTAA >26695-L2-Red-Non-RD_+_RC GTTTATTCAAAGATAACAAAGATGAATGTGCATGCGCTTGAATTAAGGATAAGGATCAATCTAGCCCAATCTCTAAAGAAGAGCTTTAAGTTACTAGGCTTGCGATGTTAAACAAGGGTGTAATTGAATTTCTCAAGGCTTGATTGAGAGAAATGCTAATATTTGGTAGGTCAAAAGGAATGATAAAGGCTTACACTCAAGCAGAGAGTGAATGTTTAGCTAGCGAGTTATTACTTATTATTCCCTTTAAAAGGGTGTGAGTTTAAGGTATAAGGAAAACTTGTATCAAGTTTTGTTGGAATGGATTAGAAAAATCTGATTGGATTGACCCTTACAATTTTTCAAACCAATCGTTTAATAGCGATTAAATATGGCTATATATACTACAATAATAAGATTTTGAAAGGTTGGTA