Tryag File Manager

//home/cluster1/data/bu01/1121861/jlex/rdloci/alignments/igrs.txt

>J99_non-RD_RD-Red_1
CCTCCATAGGTAACCCATAGTTTTACCTTACTTTAGGGGTAGTTTAAGCTTTTAAATAAGGATCTCTTTTATTGTCAAATAACGCTACCATAAAAAATGATCTCAAAAGCCGACAGATAATTAAAAACTTAATGTTTTTAATCG

>J99_RD-Red_non-RD_1
TTACCAACCTTTTTTCAAAAAACAATCTTACCCATCAAAACTATATCAATGGAAACTAATACGAAAAAATCCACTCAAGTTAGATCAACCCCTTTATTA

>26695_non-RD_RD-Red_1
CCTCCATTTGTAAGTTTTACCTTACTTTAGGGATAGCTTAAGCTTTTAAATAAGGATCTCTTTTATTGCCAAATAACGCTACCATAAAAAATGTTTTCAAAAGCCGACAGATAATTAAAAACTTGGTGCAATGTTTTTAACCG

>26695_RD-Green_RD-Red_1
GGCATAAGAAAATAAGAACACCATAAAATCGTTTTTAGCTTCTAGGAGACATCAGTCAGTTTCTTGCCATAGAAAAATCGCTTATTAGCTTGCTCCCTTTAAAAGGGTGTGAGTTTAAGGTATAAGGAAAACTTGTATCAAGTTTTATTGGAATGGATTAGAAAAATCTGATTGGATTGACCCTTACAATTTTTCAAACCAATCGTTTAATAGCGATTAAATATGRCTATATACACTACAACAATAAGATTTTGAAAGGTTGGTA

>26695_RD-Red_RD-Green_1
GCATAAGAAAATAAGAACACCATAAAATCGTTTTTAGCTTCTAGGAGACATCAGTCAGTTTCTTGCCATAGAAAAATCGCTTATTAGCTTGCTCCCTTTAAAAGGGTGTGAGTTTAAGGTATAAGGAAAACTTGTATCAAGTTTTATTGGAATGGATTAGAAAAATCTGATTGGATTGACCCTTACAATTTTTCAAACCAATCGTTTAATAGCGATTAAATATGGCTATATATACTACAATAATAAGATTTTGAAAAGTGAGATTGTTTTTTGAAAGGATTTAA

>26695_RD-Red_non-RD_1
TACCAACCTTTYTTTAAMAAACAATCTTACTTTWCAAAATYATATCATGGAAACTAATACGAAAAATCCACTCAAGTTAGATTGATTTATTTATTA

>M-00-14_non-RD_RD-Red_1
AGACGCTAAGGAACTCTCTCTTTATAAGAGAGAGGTATAAAAATCATTCTTCATAATAAAACAACCCCATAAATTGCAACCGCTTGTATTTTGTGAAACGCTCAAACGCTAAAGACGATTGGAATTCCTACTAAGGAGTTTAAAAAAGGCTCTGTTCTAATTGGGTAACATAGAGTTTTTAAAATACCATAAATAAGCTAAAAACGATTTTATGGTGTTCTTATGC

>J99_non-RD_RD-Green_2
AGATCCGCTAAAATTAAAACTCTCTCTTTTAAAAGAGGGAGGTAAAAATCATTCTTTATAAAACACCGCTAAAAATTGCAACCGCTTGTATTTTGTGAAACGCTCAAACGCTAAAAATGATTAGGATTCCTACTAAGGAGTTTAAAAAAGGCTCTATTCTAATTGGGTAATATAGAGTCTTTAAAATACCATAAATAAGCTAAAAACGATTTTATGGTGTTTTCTTATGCC

>J99_RD-Green_non-RD_2
TTAAATCCTTTCAAAAAACAATCTTACCCATCAAAATCTTATTTTTGTAGTATATATAGTCATATTTAATCGCTATTAAACGATTGGTTTGAAAAATTGTGAGGGTCAATCCAATCAGATTTTTCTAATCCATTCCAATAAAACTTGATACAAGTCTGCCTTGATACCCAAATTCACACCCTTTTAAAGGGAATAATAGGTAATAACTCGCTAGCTAAACATTCACTCTCTGCTTGAGTGTAAGCCTTTATCATTCCTTTTGACCTACCAAATTATTAGCATTCCTCTCAATCAAGCCTTGAGAAATTCAATTACACCCTTGTTTAACATCGTAAGTCTAGTAACTTAAAGCTCTTTTTTAGAGATTGGGTTAGATTGATCCTTATCCTTAATTCAAGTGCATGCACATTCATCTTTGTTATCTTTAAGCAAGC

>26695_non-RD_RD-Red_2
GATCCGCTAAATTTAAAACCCCCTCTTTTAAAAGAGGGAGGTAAAAATCATTCTTCATAAAACGCCACTAAAAATTGCAACCGCTTGTATTTTGTGAAACGCTCAAACGCTAAAGACGATTGGGATTCCTACTAAGGAGTTTAAAAAAGGCTCTGTTCTAACTGGGTAACATAGAGTTTTTAAAATACTATAAATAAGCTAAGAACGATTTTATGGTGTTTTCTTATGC

>26695_RD-Red_RD-Red_2
TGTTAATAAAGAAATAGAAGCAGTTGCTAATACTGAAAAGAAAGCAGAAAAAGCGGGTTATGGTTATAGTAAAAGGATGTAGGCATAAGAAAATAAGAACACCATAAAATCGTTTTTAGCTTCTAGGAGACATCAGTCAGTTTCTTGCCATAGAAAAATCGCTTATTAGCTTGCTCCCTTTAAAAGGGTGTGAGTTTAAGGTATAAGGAAACTTGTATCAAGTTTTATTGGAATGGATTAGAAAAATCTGATTGGATTGACCCTTACAATTTTTCAAACCAATCGTTTAATAGCGATTAAATATGACTATATACACTACAACAATAAGATTTTGAAAGGTTGGTA

>26695_RD-Red_Post-RD_2
AATCTTTGTAAAAAACCCACCAACTGATCTGATTATATTTGTAATGGCATTCGCTTGTTTAAAATGAGTCTCTTTATTTGCCTTTGCGTTASTGTCTCTGCGTTTTTGCCAACTTTATTTGTTTTTCCTGTTTTTACTGATTCCATTACCAACCTTTCAAAATCTTATTATTGTAGTATATATAGCCATATTTAATCGCTATTAAACGATTGGTTTGAAAAATTGTAAGGGTCAATCCAATCAGATTTTTCTAATCCATTCCAACAAAACTTGATACAAGTTTTCCTTATACCTTAAACTCACACCCTTTTAAAGGGAATAATAAGTAATAACTCGCTAGCTAAACATTCACTCTCTGCTTGAGTGTAAGCCTTTATCATTCCTTTTGACCTACCAAATATTAGCATTTCTCTCAATCAAGCCTTGAGAAATTCAATTACACCCTTGTTTAACATCGCAAGCCTAGTAACTTAAAGCTCTTCTTTAGAGATTGGGCTAGATTGATCCTTATCCTTAATTCAAGCGCATGCACATTCATCTTTGTTATCTTTGAATAAAC

>M-00-14_non-RD_RD-Red-Long_2
CTTGGGTTACCTCCTAGTAGTTTACCTTACTTTAGGGATAGTTAAGCTTTTAAATAAGAATCCCTTTTATTACCAAATAACGCTACCATAAAAAATCAAAAGCCGACAGATAATTAAAAACTTGGTGTAATGTTTTAATCG

>M-00-14_non-RD_RD-Red-Short_2
CGTATTCTTTTGTGGTATTTTAGCAAAATCGAATAAATACCATAAAATTTCCGAGGTACAATGGGTTAATCTTGTCTTGGAAAAAATTTGAAGAATCATCCTTAGGGTTAGCAGAAATCGCAAACTCGCAAAGTGTTTTATGTTCGCCAACGTTAAAAATCGCAACAAAATACTTCTTACTAAAAATATGGAGAGAGAAATATTTCTCTCTCAAAG

>M-00-14_non-RD_RD-Green_2
GGACGCTAAGGAAACTCTCTCTTTTATAAAGAGAGAGGTATAAAAATCATTCTTCATAATAAAACAACGCCAAAAATTGCAACCGCTTGTATTTTGTGAAACGCTCAAACGCTAAAGACGATTGGAATTCCTACTAAGGAGTTTAAAAAAGGCTCTGTTCTAATTGGGTAACATAGAGTTTTTAAAATACCATAAATAAGCTAAAAACGATTTTATGGTGTTCTTATGC